简化的RNA和DNA测序解决方案，用于精简临床NGS 2020年9月1日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计，为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法，从而确保客户能够简化并整合其工作流程，而无需浪费宝贵时间针对不同样品类型优化不同试剂盒。这标志着安捷伦经过不懈努力，在利用XT HS2化学试剂的性能和通用性改进NGS应用与工作流程方面取得了最新进展。 安捷伦副总裁兼基因组学事业部总经理Kevin Meldrum表示：\"安捷伦将RNA和DNA的创新性文库制备与靶向序列捕获整合到一个平行的测序工作流程中。简化后的全新解决方案将有助于减轻技术人员的日常工作量，还可将任意样品类型文库制备的周转时间缩短为1–2天。” SureSelect XT HS2 RNA试剂盒扩展了XT HS2化学试剂在NGS中的应用范围，确保客户可利用低起......阅读全文 美发明清理DNA新方法 轻松破译古人类基因秘密 一种新技术使破译古人类DNA成本更低 研究者已经从5300年前的人类遗骸\"冰人奥茨”身上提取了基因组，还将尼安德特人的DNA进行了测序，至此人们可能会认为已经能够把古人类的整个遗传代码完整地排列出来了。但是，这些研究使用的样本都是\"完美的样本”，它们基本上深藏于冻结的土壤、冰雪或寒冷的洞穴中， 聚合酶链反应（PCR）技术的发展和应用-2 第五节 PCR各处应用模式 一、兼并引物（Degenerate Primer）PCR 密码子具有兼并性，如表22-4，单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的，但可以设计成对兼并引物，扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变，但核苷酸的数量应相同。兼并度越低， ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂（Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物，操作时应穿实验服，戴手套，存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯（DEPC) 处理的水 外显子测序——产前诊断及儿科疾病诊断的新秀本周末，由美国贝勒医学院与香港中文大学联合举办的第一届贝勒医学院-香港中文大学临床遗传学大会如期在著名的威尔斯亲王医院召开。来自贝勒医学院，香港中文大学，香港大学，复旦大学，北京协和医院，马来西亚大学，墨尔本大学等数十个中美及周边国家学术与临床机构的专家学者齐聚一堂，进行了为期两天的学术报告与交 Proton和HiSeq测序平台比较：SNPs检测均表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示，在进行外显子组测序时，Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异(SNPs)检测方面均表现良好，但在准确检测插入缺失时存在某些问题 高通量测序的应用及前景 一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤，避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力，对照一个参比基因组（reference genome）高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序（re-sequence），2007年van Orsouw 总融资9.86亿美元！基因治疗浪潮即将来袭2018年，全球都在经历一场艰难的资本寒冬。募资难、融资难、估值缩水，这是许多投资人和创业者最深的体会。但尽管在这样艰难的岁月，基因领域依然创下了约9.86亿美元的高融资额，与2017年10亿美元相比基本持平。 这一年里，NMPA批准了首款基于NGS的肿瘤检测试剂盒，燃石医学喜提中国\"肿瘤NG PCR原理分类应用及国内外主要品牌汇总 PCR概念PCR，中文名是聚合酶链反应(基因扩增)基本原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR是模拟体内DNA复制过程，在体外特异性扩增DNA片段的一种技术。PCR的应用领域：1、遗传病和某些疑难病的诊断2、病原体的检测。某些恶性疾病一般用微生 PCR各处应用模式 一、兼并引物（Degenerate Primer）PCR 密码子具有兼并性，如表22-4，单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的，但可以设计成对兼并引物，扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变，但核苷酸的数量应相同。兼并度越低，产物特异性越强，设计引物时应尽 PCR各处应用模式 一、兼并引物（Degenerate Primer）PCR 密码子具有兼并性，如表22-4，单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的，但可以设计成对兼并引物，扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变，但核苷酸的数量应相同。兼并度越低，产物特异性越强，设计引物时应尽 异显示技术（DD）实验 D D由Liang和Pardee在 1992年首次提出。至今有大约1700篇 与DD相关的文章发表，可见其影响巨大。许多与神经变性和凋亡相关的基因也通过DD的方法得以鉴定。 .DD的原理基于对cDNA分子进行随机扩增和随后按大小进行的分离。盘点：分子诊断常用技术50年的沿革与进步一、基于分子杂交的分子诊断技术 上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年，由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增，人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现，为基于分子杂交的体外诊断方法进行了 一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提...（二） 三、结果1、无苯酚/氯仿的CTAB / PVP / SDS-based RNA提取在下面介绍的第一批实验中，我们开发并测试了一种使用40-60 mg牛油果、夏威夷果和芒果成熟叶片的冷冻叶组织提取RNA的方法。在发表的文献中，用于困难树种开发的大多数RNA提取方法，通过使用CTAB / PVP 差异显示技术（DD）实验 实验材料 无菌玻璃器皿 无菌 Eppendorf试 管 Eppendorf枪头 无菌 falcon离心管 Solexa高通量测序方法 高通量测序发展的背景基因决定了一个人的相貌、身高甚至疾病，它存在于每个人体细胞的ＤＮＡ中。而组成ＤＮＡ的基本物质则是由Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ表示的４种碱基，一个人的基因组测序就是排列出其ＤＮＡ上所有碱基的顺序。如果每个人都能拥有一份属于自己的基因组图谱，那么科学家们长期以来期待的\"个性化医疗时代”就会可能成 国自然研究热点—eccDNA的前世今生​1. eccDNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生 纳米孔测序搞定超级难搞的基因Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论 纳米孔测序搞定超级难搞的基因Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定，通量也不高，但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION，众多讨论 一波新的CRISPR工具浮出水面当你读到这篇文章时，又一波CRISPR工具将会浮出水面。它们将需要接受测试和优化。不过，如果你询问开发者你在开展概念验证研究时是否应当试用它们时，你将仅获得鼓励。毕竟，迄今为止它们还不能从Addgene公司获得，但是将会很快上市了。 最新发布的一系列CRISPR工具包括新的谱系追踪方法，该方法 安捷伦最新推出百万特征序列格式的基因表达微阵列芯片 2010 年 5 月 19 日，加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所：A) 今日发布了安捷伦 SurePrint G3 基因表达微阵列芯片，该产品在 1 英寸×3 英寸的单位标准芯片上提供的特征序列可多达一百万种，大幅提高了通量，有效节约了成本，并且具有独一无二 Proton和HiSeq外显子组平台比较 Proton和HiSeq外显子组平台比较：单核苷酸变异检测均表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示，在进行外显子组测序时，Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检 Proton和HiSeq平台比较 单核苷酸变异检测表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示，在进行外显子组测序时，Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检测方面均表现良好，但在准确检测插入缺失时存在某些问题。 该 植物生物学研究数据库 实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt 2017年5月CRISPR/Cas亮点盘点基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一，受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称，Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的，是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。 云序Mol Cancer成果教您如何写出外泌体的10分文章文章导读 2020年3月20日，云序客户上海交通大学附属第一人民医院田聆教授课题组在高分期刊Moleular Cancer杂志（影响因子10.679）发表了关于外泌体在胰腺癌肿瘤再生长中的研究。肿瘤再生长是放射治疗失败的主要原因。以往的研究表明，死亡的肿瘤细胞通过促进残留的肿瘤再生细胞(T CRISPR/Cas9应用近期重大进展基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一，受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称，Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的，是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。 昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nature，Cell 云序高分文章利器：​ctDNA（羟）甲基化测序案例分享新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主 Nature 子刊：第三代测序技术或将迎来新升级第三代测序技术，即单分子测序技术，又称纳米孔测序，以美国太平洋生物（Pacific Biosciences）的 SMRT 技术为代表。DNA 测序时，不需要经过 PCR 扩增，实现对每一条 DNA 分子的单独测序。 SMRT 测序面临的一个挑战是将更长的 DNA 分子放入 100 纳米大小的零 盘点：下一代测序技术在日常生活中的10大应用成瘾 科罗拉多大学健康和成瘾中心：神经科学、基因和环境的研究人员希望了解对酒精和大麻成瘾是如何发展的。他们正通过表观基因组来寻找答案。表观基因组位于基因组之上，是DNA周围的化合物网络，它们修饰基因组，却不改变DNA序列。通过靶向的甲基化测序，研究人员正在确定与药物滥用者的大脑扫描图像相关的表